Music Of Tha Day-ah.

Musik des Tages ist Kaizers Orchestra! Kudos an Nelly! And a big shout out to the beautiful Guro and my homie Tom "TML" Jensen, drop me a line!
PS: I know it ain't the official site, but HERE you can download their stuff...

"pretty fly, for a white guy."

Lange nix geschrieben. Sorry. Es ist einfach wenig passiert.
Meine Experimente sind genau im Plan. Ich habe die letzten Tage mit Meetings verbracht, mit den Flow Cytometrie-Personen gesprochen, die meine Zellen sortieren sollen, ich habe das Protokoll für die enzymatische Dissoziation der Gehirne ausprobiert (d.h. das "Kochrezept", mit denen ich aus kompletten Gehirnen eine Suspension frei schwimmender Zellen machen kann) (die ich dann kultiviert habe, sie leben nach drei Tagen immer noch!), und mich mit dem Microarray-Fachmann getroffen, der ein paar tolle Vorschläge zum Design der Experimente hatte. Als nächstes stehen Pilot-Durchläufe an: ich werde in den kommenden zwei Wochen zur Probe ein paar Gehirne mit FACS (Fluorescence-activated Cell Sorting) sortieren und ein paar miR-Profile mithilfe von miRNA-Microarray-Chips aufnehmen! Den genauen Hintergrund erkläre ich dann, wenn ich die jeweiligen Versuche gemacht habe. Wünscht mir Glück!
Außerdem ist Jetze hier eingetroffen: Er studiert Medizin in Groningen und verbringt wie ich ein paar Monate als Austauschstudent an der Penn. Unsere freundliche Austausch-Koordinatorin Nancy hat mich mit ihm in Kontakt gebracht, und ich hatte das Vergnügen, ihn gestern von Bahnhof abzuholen und im International House abzuliefern. Der Arme musste in Wash DC auf dem Flughafen übernachten, da ein Tornado den gesamten Flugverkehr an der Ostküste lahmgelegt hatte. Am Ende war er fast 40 Stunden unterwegs, und sein Koffer war auch weg. Da sind wir erst mal Kaffee trinken gegangen. Aber mein Holländisch ist echt eingerostet, oh Mann...

Sorry, it's been a while. But there's just not a lot going on right now.
My experiments are right on track. I spent the last week in meetings, talking to the flow cytometry experts who are supposed to sort my fly brain cells, I tried out the protocol for enzymatic digestion (which are the instructions how to turn whole brains into a single-cell suspension we can then sort according to cell type) and cultured the cells, they are still alive after 3 days! Also I met with our microarray-expert, who had a lot of helpful suggestions for the experimental design. In the next two weeks, I hope to do a test run for the sorting and a first microarray to record the general miRNA expression in brains. I'll give you guys more scientific background as soon as I have completed the experiments, so keep your fingers crossed for me!
Also, I picked Jetze up from the train station here at Penn, a fellow exchange med student from Holland (Groningen, to be precise). Our friendly exchange coordinator Nancy established a contact, so I was able to make sure Jetze got to the International House upon his arrival. He had been stuck in Wash DC for a whole night, since some tornado prevented all air traffic along the east coast for almost 12 hours. By the time he got here, he'd been on the road some 40 hours, and the airline lost his suitcase. So we went and had coffee. (Yes, coffee is the answer. At this point, I wave to Hans in Leiden. He knows.)
-Jetze, zoals je deze post kun zien, bel mij op, ik find een biertje (of twee) morgen avond een echt leuk idee!-
My Dutch's gone rusty, people... not that it was ever gopod, but it's getting even worse...

Decoration of Independence ("Die Unabhängigkeitsdekoration")

Heute hat die Uni die Weihnachtsdeko aufgehängt- schööööön...
Meine grünen Larven von gestern sind heute grüne Fliegen geworden. Morgen werde ich wissen, ob sich deren Gehirne (siehe Bild, alle grünen Punkte sind Neuronen) kultivieren lassen. Sehenswert: die optischen Neuronen am oberen Bildrand!

today the university put up the Christmas decoration- preeeeetty...
My green larvae from yesterday turned into flies today. Tomorrow I'll know whether I can culture their brains (pic). Note the optical neurons at the top!

Grün grün grün sind alle meine Larven...

Heute gab es die ersten Laven der F1-Generation meiner repo-gal4 x UAS-GFP Kreuzung, d.h. die ersten Fliegen, die das grüne Protein (grün fluoreszierendes Protein, "GFP") in ihren Nervenzellen produzieren. Wenn ich die nun mit UV-Licht bestrahle, leuchten alle betroffenen Zellen grün. Dieses Schauspiel lasse ich mir nicht entgehen und habe erst mal eine Larve unters Konfkal-Mikroskop gelegt. Das Ergebnis seht Ihr oben. Links am Bildrand ist der Mund der larve, der grüne Blob ist das Nervenzentrum (man könnte sagen Gehirn). Alles grüne sind Glia-Zellen, der zweithäufigste Zelltyp im Hirn. Nett, ne??
Morgen werde ich sehen, ob die die grünen Zellen extrahieren und kultivieren kann.

Today, I picked the first offsprings of my repo-gal4 x UAS-GFP cross, i.e. flies that make green fluorescent protein in their nerve tissue. When I shine some UV light on them, they'll shine back bright green. Not wanting to miss the show, I shoved some under my fluorescence scope. The result you can see above. On the left is the larvae's mouth, the big greeen blotch is the nerve center (you might want to say "brain"). All that is green are glial cells, the second most abundant cell type in nerve tissue. Tomorrow I'll check if I can extract and cultivate those green cells. Neat, huh?

Tourist Time Part III

Tagesprogramm: Mehr Museen. Zuerst das Franklin Institute mit seiner 6 Meter großen Marmorstatue des sitzenden Benjamin Franklin in der neoklassizistischen Lobby: hier gibt es eine sehenswerte Ausstellung zu Charles Darwin, in der sehr anschaulich die Person und weniger die Entdeckung dargestellt wird. Es ist sehr inspirierend, seine Briefe und Aufzeichnungen in natura zu sehen und einen Einblick in die Arbeitsweise seines großartigen Verstandes zu bekommen. Außerdem ist es schön zu wissen, dass auch aus "Käfersammel-Kindern" etwas werden kann. Leider wurden die Kreationismus-Idioten nur mit ein paar leisetreterischen Erklärungen abgehandelt, dass "Theorie" wissenschaftlich mehr bedeutet als "unbewiesene Spekulation". Und das, nachdem in der ganzen Ausstellung überwältigend klar die wissenschaftliche Beweislage von damals bis heute dargelegt wird.
Neben dem Franklin befindet sich die Academy of Natural Sciences, die über eine beeindruckende Kollektion von naturhistorischen Präparaten verfügen. Leider sind diese entweder für die Forschung reserviert (die ganzen Dino-Skelette sind Abgüsse der in der Sammlung befindlichen Originale) oder im Rahmen der kindgerechten Gestaltung der Ausstellung nur am Rande eingebunden. Ich kann sicher nicht für die Kids von heute sprechen, aber ich hätte mir als 6-jähriger eher ein paar Oktopedi (Oktopusse? Oktopussi?) in Alkohol gewünscht, als einen Plastikdino, der auf Knopfdruck kreischt... Nunja.

Day's program: More musea. At first, the franklin Institute with its freakishly hughe marble statue of Franklin in the neoclassical lobby. They boast an interesting exhibition on Charles Darwin that sets out to describe the person rather than the scientific background of his discovery. I found it very inspiring to see some of his original notes and artefacts that he brought from the HMS Beagle cruise; I personally would have loved to see the creaters of the exhibit rip into the creationist morons a little harder; they just gave a short explanation how "theory" in science means more than "unproven speculation". Especially with the impressive recap of the accumuation of supporting scientific facts from the 1820s until today, a few more words would have been appropriate.
Next to the Franklin lies the Academy of Natural Sciences that holds a unique collection of specimens. Unfortunately, they are reserved for research (almost all dinosaurs on display are plastic casts as the originals remain in the labs and archives), or have been omitted due to making the exhibition more "kid-friendly". Honestly, as a six-year old (collector of gross things that I was), I would have greatly preferred to see some real mollusks in alcohol jars than a plastic dino that shrieks when I press some button. But that's just me.