Friday, November 24, 2006

Giving Thanks 4 ThanksGiving

Der menschliche Fußball ("Hier wird der Fußball mit Füßen getreten" - Franz 'Werder' Böhmert) ist wieder da. Genaugenommen war er bist gestern noch kein Fußball, sondern ein Grad Student an der Penn, aber dann hat die liebe Jess ihn zum Thanksgiving-Dinner mit ihrer Familie eingeladen, und heute erinnert nichts mehr an seine ehemals menschliche Form. Ihr wisst, wie jeder Super-Bösewicht (sei es bei James Bond oder Spiderman) mal respektiertes Mitglied der Gesellschaft war, bis ihn irgendein Eregnis in das unmenschliche Wesen verwandelt hat, das er nun ist. Wenn ich jemals James-Bond-Villain werde, so wird es eine Flashback-Szene geben, in der der sanftmütige Dr. M. F. bei einem Thanksgiving-Dinner in den "BLOB" transformiert wird...
Jedenfalls hatt ich einen großartigen Tag mit einer sehr warmherzigen Familie und durfte neben einem riesigen Truthahnbraten mit Püree, Brokkoli, Süßkkartoffelauflauf etc. noch Konversation zu Themen wie "Deutsche Traktoren: Welche bringen den besten Gegenwert in der 100 PS-Klasse?" und "Nordkorea: Die Schlitzaugen-Bedrohung bekämpfen, indem man Frankreich bombardiert?" führen.
Alles in allem, ein geselliger Tag! Heute habe ich bewiesen, dass 50 Fliegenköpfe leicht 10µg RNA liefern können, auch wenn die Hose kneift.

The human soccer ball is back. (My favourite soccer quote: "Here, soccer is being kicked with the feet", Franz Böhmert, manager of Werder Bremen)(I swear, it's funny in German!)
The be precise, he wasn't a soccer ball yesterday, but a grad student at Penn, until dear Jess invited him to the big Thanksgiving dinner with her family; now today, nothing resembles its originally human shape. You know how every super-villain (be it an adversary of James Bond or Spiderman) was once a respected member of society, until a freak incident transfomred him into the unhuman being he now is. If I ever get to be a Bond villain, the movie will feature a flashback scene where mild-mannered Dr M. F. is transformed into THE BLOB during a Thanksgiving dinner.
Anyway, I had a wonderful day with a very warm-hearted and sweet family, and could, besides eating a giant turkey, mashed püotatoes, sweet potatoe casserole, broccoli and much, much more, enjoyed conversations I never thought myslef capable of participating in, such as "German tractors: which give the best return on investment in the 100HP class?" and "North Corea: Solve the conflict by bombing the French?".
All in all, a great day. And today I showed that one can easily isolate 10µg of RNA from 50 fly heads, even if your pants don't fit anymore.

Wednesday, November 22, 2006

The FACS of life, oder: Michael macht FACSen


Der Report meiner Träume!

Heute war der große Tag: ich habe 115 Fliegenhirne (zweimal 115, eigentlich) enzymatisch dissoziiert und mittels FACS in GFP-positive und -negative Zellen sortiert.
Nochmal: Meine Fliegen machen grünes Protein in bestimmten Zellen ihres Gehirns. Indem ich die Gehirne isoliere und mit einem Enzym behandele, dass das Hingewebe zersetzt und in einzelne Zellen zerlegt, kann ich aus einem Klumpen eine milchige Lösung machen, in der grüne Zellen (Neuronen) und andere Zellen frei herumschwimmen.
An diesem Punkt kommt FACS ins Spiel. FACS steht für "Fluorescence Activated Cell Sorting" und bedeutet in meinem Fall: grüne Zellen aussortieren.
WIe funktioniert das? Meine Zell-Lösung wird durch eine extrem feine Glaskapillare gepumpt, die so dünn ist, dass die Zellen "im Gänsemarsch" hindurchwandern. Ein Laser mißt dabei die Fluoreszenz einer jeden Zelle. Da bei meinen Fliegen nur Neuronen grün fluoreszierendes Protein erzeugen, leuchten nur Neuronen grün. Am Ende der Kapillare werden die Zellen in kleinen Tropfen (eine Zelle pro Tropfen) in ein Reganzglas getropft. Wenn der Laser eine grüne Zelle entdeckt, gibt er ein Signal an eine Kathode und Anode am Ende der Kapillare ab. Diese legen eine Spannung an das Kapillarenende an, die genau DEN Tropfen, der die grüne Zelle enthält, in ein zweites Reagenzglas umlenkt. Also: die Grünen ins Töpfchen, die Schlechten ins andere Töpfchen. So kann man in ein paar Minuten ein paar Millionen Zellen sortieren, und am Ende war ich stolzer Besitzer von 13.300 Glia-Zellen und 66.900 Neuronen, aus denen ich die RNA extrahiert habe. Was damit geschehen soll, erzähle ich Euch beim nächsten Mal.
Dies ist übrigens ein Beinahe-Novum, denn es gibt in der Literatur nur eine Beschreibung von FACS-sortierten Fliegenhirnen!

Today was the big day! i dissected 115 fly brains (2 times, actually) enzymatically and sorted them into GFP-positive and GFP-negative cells.
Again: My flies make a green fluorescent protein in distinct cells of their brain. I isolate their brains and treat them with an enzyme that cuts the brain tissue into individual cells. Thus, a pieve of gory insect brain turns into a suspension of single cells. This is where FACS comes into play. FACS stands for "Fluorescence Activated Cell Sorting", in my case, that menas "green cells are picked out of the suspension".
How does that work? My suspension is pumped through a tiny capillary, so thin that all cells have to move through it in single-file. A laser shines on each one of them and measures their ability to fluoresc in green light, which, in my case, are only neurons, for they make green protein. At the end of the capillary, the cells drip into a tube in tiny drops that contain one cel per drop. If the computer behind the laser registers a green cell, he applies an electric field to the end of the capillary. The drop containing the green cell is being re-directed by the electric field and drops into another tube than the rest of the cells. Thus, I can get a pure population of just one cell type!
This way, I can sort a few million cells in a few minutes, and in the end, I was proud owner of 13.300 glial cells and 66.900 neurons. From these, I extracted RNA. Why I did that, I will tell you next time.

Monday, November 20, 2006


Mein Bruder hat ein neues StudiVZ-Foto, dass man der Welt nicht vorenthalten darf.

My brother got a new StudiVZ profile photo that must not go unshared. Note the great T-Shirt, hinting at a relentlessly sweet taste in music.

Sunday, November 19, 2006

Just another manic sundae


Das Maennchen auf demSchild wird es ueberstehen, er traegt einen Helm (halbe Wassermelone? Topf-Haarschnitt?)...
The guy on the sign will be alright, I think he's wearing a helmet (half a watermelon? mushroom haircut?)...

Es ist Sonntag. Aber zur Abwechslung habe ich Gesellschaft und mu� mich nicht allein in der �ffentlichkeit zeigen. beste Umst�nde, um ein gesellschaftliches Event wie den Philadelphia-Marathon (42,2 Frischk�se-Schnitten in unter 3 Stunden?) zu besuchen. Jetze und ich sind morgens aufgebrochen, umm mit Kaffeebecher in der Hand -grande non-fat double defac ginger latte- abgek�mpften Athleten beim �berqueren der Ziellinie zuzuschauen und uns gegenseitig zu versichern, dass wir es nicht bis hier bringen w�rden. Bis Jetze offenbart hat, dass er selbst eine Vergangenheit als Leistungssportler, Mittelstrecke, hat. Verr�ter. Das �bliche Programm, Delaware, Independence Hall, habe ich schon im Detail beschrieben. Was ist von einem Metalldetektor zu halten, der le Portemonaie voller Kleingeld in der hinteren Hosentasche ignoriert? Alles in allem, ein sch�ner Ausflug. Und beim Kerl mit dem "Iron Maiden"-Shirt hinter mir hat es auch nicht gepiepst (METAL-Detektor, kapiert?!). In der Schlange mitangeh�rt: "Ich habe den ganzen Tag im Pyjama auf der Couch gesessen." Wie haben die die Couch in den Pyjama gekriegt?!
Irgendwo in der Ferne sendet Alex/Luise/Jens/Georg mir einen telepathischen Bitchslap.
Und Nils einen telepathischen High Five.
Schreibt man Telepathie eigentlich mit "h"?
Den zweiten teil des Abends habe ich mit meinem Nachbarn Adam und ein paar Freunden im neuen James Bond verbracht.
Ich bin sicher nicht qualifiziert, fein nuancierte Filmkritiken zu verfassen, aber es ist der Beste James Bond seit Roger Moore nicht mehr mitmacht. Er suhlt sich in subtiler Ironie: james reist auf die Bahamas, die Sonne scheint, Palmen, eine gewundene Strasse, man h�rt Motorenger�usch und denkt, gleich kommt James in einem ABSPRITZ- Auto um die Ecke, und dann f�hrt von er links in einem Leih-Ford Focus ins Bild. Ich habe mich im Kino lange nicht mehr so gefreut.

It's Sunday. But for a change there is company and don't have to attend public events without company. What better time to attend a public event like the public Philadephia marathon? Jetze and I went to look at beaten-down people crossing the finish line, coffee cup in hand (us, not the people), grande double cream nofat dairy ginger latte, boy did a coffee ever sound gay. We assured us that we wouldn't make it over that finish line until Jetze revealed that he has a history of being an athlete. Traitor! (just kidding dude). We then went on to see the sights, Independence Hall and the Delaware, each of which I have already described in greater detail. But what should i make of a metal detector that can't find a wallet stuffed with change in my back pocket? And the guy right behind me with that "Iron Maiden"-Shirt? (Get it?!? METAL-detector?? HAHA.) Also, overheard in the line: "I spent all day on the couch in my PJs." How'd they get the couch into the PJs?
Somewhere in the distance, Alex/Georg/Luise/Jens are using ESP to go upside my head.
And Nils is sending some ESP-high five.
The second half of the day I spent with my neighbour Adam and some friends watching the new Bond. i am not qualified to give detailed movie criticism, but I found it to be the best Bond since Roger retired. It is dripping with subtle humor. James travels to the Bahamas, you see the sun, palm trees, a winding road, hear a car and think James is gonna pull up on some BONER-wheels, and then he rolls in on a Hertz Ford Focus. Has been a while since I had this much fun in a theater.